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Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour votre PME ? [Comparatif 2024]

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour votre PME ? [Comparatif 2024]

Par Coralie Petit

Mis à jour le 28 août 2024, publié initialement en 31 mai 2021

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour une PME ? Une question pour laquelle la réponse n’est pas évidente.

En effet, les petites et moyennes entreprises ont des effectifs allant de 10 à 250 employés et un chiffre d’affaires inférieur à 50 millions d’euros.

Le spectre est très large et les structures n’ont donc pas les mêmes besoins de l’une à l’autre. Êtes-vous plutôt une petite PME ou proche de l’entreprise de taille intermédiaire (ETI) ?

Vous l’avez compris, pour faire le bon choix, tout dépend de la taille de votre PME, de l’étendue de vos activités, mais aussi de vos perspectives de développement.

Voici un comparatif avec quelques références du marché en comptabilité pour répondre aux critères de sélection incontournables de votre entreprise.

Nos 10 meilleurs logiciels de comptabilité pour PME

Axonaut

Indy

Cegid Quadra Entreprise

EBP Comptabilité

iPaidThat

Pennylane

Sage 100c Comptabilité

Sinao Comptabilité & Gestion

Xero

Pour entreprises de 1 à 50 salariésPour entreprises de 1 à 50 salariésPour entreprises de 2 à 50 salariésPour entreprises de 1 à 250 salariésPour entreprises de 1 à 250 salariésPour entreprises de 1 à 250 salariésPour entreprises de 51 à 250 salariésPour entreprises de 2 à 50 salariésPour les entreprises de plus de 1 salariés
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Version payante dès 41,99 € /mois

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Version payante dès 12,00 € /mois

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Tarif sur demande

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Version payante dès 30,00 € /mois

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Version payante dès 59,00 € /mois

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Version payante dès 14,00 € /mois

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Tarif sur demande

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Version payante dès 12,00 € /mois

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Version payante dès 20,00 $US /mois

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Axonaut

Axonaut est une solution tout-en-un conçue spécifiquement pour les besoins de PME. Ses fonctionnalités de comptabilité avancées sont intégrées à un éventail d’outils de gestion d’entreprise plus généraux.

Qu’espérer d’Axonaut ? La tenue des comptes, la gestion des flux de trésorerie et la collaboration avec les experts-comptables.

Les points forts

  • Axonaut se distingue à travers sa capacité à combiner la comptabilité avec des outils de gestion de projet ou CRM. Les entreprises peuvent gérer l’ensemble de leurs opérations sans jamais avoir à jongler entre différents logiciels.
  • Les tâches récurrentes et rébarbatives sont automatisées, dont la saisie des écritures comptables ou la gestion des factures. Vous profitez ainsi d’un gain de temps considérable tout en réduisant le risque d’erreurs.
  • Les différents tableaux de bord offrent une vue d’ensemble en temps réel de vos finances. Ils sont personnalisables et s’adaptent à vos besoins spécifiques en fournissant les informations clés à votre entreprise.
  • Les données sont sécurisées et conformes aux normes fiscales et comptables en vigueur en France. En prime ? Une tranquillité d’esprit et moins d’erreurs.

Inconvénient

De prime abord, l'interface utilisateur est intuitive. Pourtant, toutes ses fonctionnalités peuvent vite vous submerger, surtout si vous n'avez pas l'habitude des logiciels de comptabilité et de gestion d'entreprise.

Prix

Comptez au moins 29,90 €/mois, mais prévoyez davantage si vous souhaitez personnaliser l’offre et ajouter des modules supplémentaires.

Cegid Quadra Entreprise

Cegid Quadra Entreprise est un logiciel de gestion d'entreprise conçu pour répondre aux besoins complexes des PME. Il intègre des fonctionnalités étendues en matière de comptabilité et de gestion financière.

Ce logiciel cible tout particulièrement les entreprises en quête de solution complète pour gérer efficacement leur finance et leur comptabilité, le tout en bénéficiant d'une interface ergonomique et d'une intégration fluide avec d'autres outils.

Points forts

  • Cegid Quadra Entreprise propose une gestion comptable avancée à travers des analyses détaillées de vos finances et une tenue de vos livres de comptes précise. Vous gagnez ainsi en efficacité dans la gestion des actifs et vous consolidez les finances de manière à répondre aux besoins spécifiques des PME.
  • Ce logiciel intègre également des fonctionnalités de gestion de paie et de ressources humaines. Les outils d’administration plus généraux peuvent être gérés directement depuis Cegid, permettant une gestion unifiée et cohérente de l’ensemble de vos opérations.
  • Il garantit que la conformité fiscale est complète à travers des options avancées de rapports et de bilans, qui sont indispensables pour les entreprises soumises à des réglementations rigoureuses.
  • Très flexible, il se connecte à d'autres systèmes et s'ajuste aux particularités de différents secteurs grâce à des modules personnalisables. Ce point lui permet de répondre aux besoins spécifiques votre entreprise.

Inconvénient

L’interface utilisateur pourrait être améliorée.

Prix

L’abonnement se fait sur demande et s’adapte à la structure de votre entreprise.

EBP Comptabilité

EBP Comptabilité est une solution de gestion comptable déjà bien établie sur le marché français, particulièrement adaptée aux petites et moyennes entreprises.

Ce logiciel répond aux besoins spécifiques de notre marché national en termes de comptabilité et vous évite les erreurs qui peuvent vous coûter cher (sans mauvais jeu de mots). En outre, EBP vous accompagne dans la tenue des livres de comptes, la préparation des bilans et vos déclarations fiscales. L’accent est mis sur le respect des normes françaises, il est donc plus fiable et rassure les entreprises françaises. 🥖

Points forts

  • EBP se distingue par sa conformité stricte aux normes (fiscales et comptables) françaises. Ce point et d’autant plus cruciale pour les entreprises qui doivent opérer dans un cadre réglementaire.
  • Il offre un système avancé pour gérer la TVA et les dépenses. Cette fonctionnalité permet de générer automatiquement des déclarations fiscales, ce qui simplifie grandement les opérations comptables.
  • Vous pouvez surveiller de manière détaillée la situation de trésorerie grâce aux outils d'analyse financière, de quoi améliorer la prise de décisions stratégiques.
  • Le support technique vous accompagne avec réactivité et vous aide à tirer le meilleur parti du logiciel. A fortiori, vous optimisez votre utilisation tout en vous y adaptant en douceur.
  • L’interface utilisateur est fluide et personnalisable, son utilisation s’en trouve facilitée. Au final, la gestion est moins chronophage et plus agréable.

Inconvénient

Certaines entreprises peuvent trouver le logiciel limité en termes de personnalisation ou de fonctionnalités comptables très spécifiques et plus complexes.

Prix

EBP adapte ses tarifs à vos besoins et à votre entreprise.

Indy

Indy (anciennement Georges, le robot comptable) est idéale pour les indépendants et petites entreprises désireuses de faciliter leur gestion financière.

Grâce à son approche centrée sur l'automatisation et la simplicité, Indy transforme la façon dont les professionnels gèrent leur comptabilité, en offrant une solution intuitive et efficace.

Points forts

  • Indy est très performant dans l'automatisation des tâches comptables. Il catégorise les dépenses et enregistre les recettes, ce qui réduit le besoin d'intervention manuelle et vous permet de gagner un temps précieux.
  • L'interface se distingue par sa clarté et son côté intuitif, ce qui la rend accessible même pour les novices en comptabilité. Il n’est donc pas nécessaire de vous former à l’utilisation du logiciel grâce à une prise en main facilité.
  • Le logiciel se connecte à vos comptes bancaires pour suivre en temps réel les transactions financières. Vous avez ainsi une vision globale et actualisée de votre situation financière.
  • Indy génère automatiquement vos déclarations fiscales en simplifiant considérablement le processus de conformité. Vous êtes moins enclin à commettre des erreurs lors de cette démarche stricte.

Inconvénient

En cas de soucis, le service client n’est joignable que depuis le chat.

Prix

Indy offre des tarifs compétitifs pour répondre aux besoins des petites entreprises, avec des abonnements à partir de 29 €/mois.

IPaidThat

IPaidThat est un logiciel de précomptabilité destiné aux dirigeants de TPE et PME (et surtout aux débutants en comptabilité). Il permet d’automatiser la gestion de la comptabilité en récupérant les factures reçues, en contrôlant notamment les impayés et en transmettant toutes ces informations à l’expert-comptable de l’entreprise.

Points forts

  • L’intégration et l'automatisation impliquent l’importation de vos données (montants, dates, TVA, numéros, etc.) depuis les documents comptables, les e-mails ou les sites de vos fournisseurs. En prime, le classement et le tri automatiques de vos factures et de vos dépenses sont assurés grâce à la connexion avec votre compte bancaire.
  • Le tableau de bord permet un suivi en temps réel de votre trésorerie et de vos factures. La gestion des notes de frais et des documents comptables est plus simple et vous donne ainsi une vision plus globale de votre situation financière.
  • IPaidThat détecte automatiquement les anomalies au niveau des transactions et des documents comptables et vous en informe via notifications.
  • L’intelligence artificielle vous accompagne dans votre gestion comptable, les données clés sont extraites à partir de différentes sources. In fine, c’est un gain de temps et d’efficacité.

Inconvénient

Le logiciel peut rencontrer des difficultés à lire et reconnaître les factures, ce qui peut vite devenir contraignant.

Prix

À partir de 49 €/mois/utilisateur.

MaCompta

MaCompta est une solution de comptabilité en ligne conçue spécialement pour les PME et les entrepreneurs. Par sa simplicité et son accessibilité, elle se démarque et rend la gestion comptable moins effrayante pour les non-spécialistes.

Que peut-on attendre de MaCompta ? Un éventail d’options avancées en constante évolution et une application qui s’adapte à vos besoins.

Points forts

  • MaCompta simplifie le calcul et la déclaration de la TVA ou de vos bilans en intégrant des taux spécifiques pour diverses catégories de biens ou services. Le tout est automatisé et vous évite de faire cette tâche répétitive (quoiqu’ennuyante) manuellement.
  • Il simplifie également la saisie des écritures comptables grâce à un assistant guidé, idéal pour les comptables en herbe, moins familiers avec les principes.
  • Les paiements et factures sont directement intégrés sur MaCompta, la gestion des flux de trésorerie est simplifiée et ne nécessite pas d’action manuelle de votre part.
  • Le support client est réactif et vous accompagne dans vos démarches en cas de doute. En prime, de nombreuses ressources en lignes sont disponibles et vous permettent de mieux appréhender les différentes options.

Inconvénient

Bien que MaCompta soit facile d’utilisation, l’interface est moins moderne que d’autres logiciels et la navigation en ressort moins agréable.

Prix

MaCompta propose des abonnements adaptés à la structure de votre entreprise, les tarifs sont donc disponibles sur demande.

Pennylane

Pennylane est un logiciel de comptabilité et de facturation en ligne adapté aux dirigeants de PME, TPE et start-ups.

Ce logiciel complet allie technologie et approche personnalisée pour offrir une expérience sur mesure. Il prend en charge tous les aspects de la gestion après-vente, tels que la facturation, l'encaissement, le paiement fournisseur et la gestion de trésorerie, simplifiant ainsi l'intégralité des opérations comptables et financières.

Points forts

  • Pennylane simplifie la coopération entre les chefs d'entreprise et leurs comptables, en permettant un accès immédiat aux informations financières à travers une mise en forme personnalisée et sur mesure.
  • Il diminue fortement le temps consacré à la comptabilité et à la facturation en automatisant les tâches répétitives, ce qui permet aux dirigeants de se focaliser sur leur activité principale.
  • Des options avancées pour gérer les ventes et les achats sont disponibles, notamment la personnalisation des devis, la transformation rapide des devis en factures, et la gestion centralisée des factures des fournisseurs.
  • Avec des outils de suivi et d'analyse de trésorerie personnalisables et automatiquement mis à jour, les dirigeants peuvent gérer efficacement leur trésorerie et anticiper les dettes et créances.

Inconvénient

Bien qu'il offre une gestion comptable complète, les utilisateurs novices devront investir du temps pour maîtriser pleinement le logiciel. Ce temps initial est nécessaire pour maîtriser les avantages et les nombreuses fonctionnalités quelque peu complexes.

Prix

À partir de 19 € HT/mois. Vous avez accès à l’ensemble des fonctionnalités, support client ainsi que l’aide d’une équipe dédiée au lancement et à l’accompagnement.

Sage 100cloud Comptabilité

Sage 100cloud Comptabilité est une référence du marché en gestion comptable, analytique et budgétaire. Il s’agit de la nouvelle génération du logiciel initialement connu sous le nom de Ciel Compta. Elle s’adresse aux PME de plus de 50 salariés, mais aussiaux ETI, donc le logiciel pourra vous suivre si votre croissance vous fait passer de PME à ETI ! Ses fonctionnalités sont modulables pour s’adapter au mieux aux besoins spécifiques.

Points forts

  • Sage 100cloud Comptabilité fait partie d’une suite de gestion intégrée vous permettant de piloter entièrement votre business depuis Sage, qu’il soit question de gestion bancaire ou commerciale. En prime, le logiciel est compatible avec la suite Microsoft et les réseaux sociaux.
  • Il automatise le calcul de données comme la TVA et les échéances, tout en gérant efficacement la facturation, les mouvements de trésorerie, ainsi que les retards de paiement grâce à des relances automatiques.
  • L'outil d'analyse financière génère des rapports détaillés sur vos achats, vos dépenses et vos coûts de production. Les tableaux de bord sont ajustés pour permettre un suivi en temps réel des principaux indicateurs, ce qui est crucial pour la prise de décisions.
  • En outre, l’enregistrement des écritures comptables et des rapprochements bancaires permet une saisie précise des écritures comptables et facilite le rapprochement bancaire, essentiel pour une comptabilité exacte.

Inconvénient

Si Sage 100cloud Comptabilité est très complet, sa complexité peut poser problème aux PME disposant de peu de personnel dédié à la comptabilité. Il peut être nécessaire de suivre une formation approfondie pour maîtriser toutes ces fonctionnalités, ce qui peut demander un investissement en temps et en coûts supplémentaires pour certaines entreprises.

Prix

Les tarifs sont établis sur demande et commencent à 150 €/mois.

Sinao Comptabilité & Gestion

Sinao Comptabilité & Gestion est spécifiquement conçu pour les indépendants, TPE et PME de tous secteurs d’activité. Ce logiciel offre une gestion simplifiée de la précomptabilité, de la facturation, des dépenses et de la trésorerie, le rendant idéal pour ceux qui cherchent une solution comptable efficace et facile à utiliser.

Points forts

  • Une fois validés par les clients, les devis sont automatiquement convertis en factures. Cette fonctionnalité permet de gagner un temps précieux, réduisant le processus manuel et évitant les erreurs. En prime, vous pouvez mettre en place une facturation périodique générée automatique. Cette option est idéale pour les entreprises ayant des modèles de revenus récurrents, comme les abonnements ou les contrats de maintenance.
  • La base de données clients est maintenue à jour en intégrants les informations clés. Cette fonctionnalité permet une facturation plus rapide et plus précise, ainsi qu'une meilleure compréhension des besoins des clients. Vous pouvez notamment retrouver :
    • les coordonnées,
    • l’historique de facturation,
    • les préférences,
    • les interactions passées.
  • Les tableaux de bord offrent une vision claire des transactions comptables et des résultats financiers de votre entreprise, tels que le revenu total et les dépenses mensuelles. Ces tableaux respectent les normes comptables et vous donnent un accès immédiat à la situation financière de votre société.
  • Votre compte bancaire est directement connecté au logiciel. Cette fonctionnalité vous permet de suivre en temps réel vos mouvements financiers et d'automatiser le calcul de la TVA à partir des transactions. Ce point s'avère particulièrement utile pour les entreprises qui traitent un grand volume de transactions. La conformité fiscale est assurée, ce qui permet d'éviter les risques d'erreurs manuelles.

Inconvénient

Sinao peut vite devenir limité pour les entreprises qui ont besoin de fonctionnalités plus poussées.

Prix

Sinao propose 2 formules pour mieux convenir aux petits budgets :

  • 25 € HT/mois pour une gestion standard de la comptabilité,
  • 50 € HT/mois pour un pilotage plus poussé.

Xero

Xero est une solution basée sur le cloud et réputée pour sa flexibilité. Il est conçu pour les petites entreprises et celles de taille moyenne qui cherchent à augmenter leur efficacité comptable.

L'application permet de coordonner et de gérer tous les processus financiers au sein d'une plateforme facile à utiliser et accessible depuis n'importe quel appareil connecté à Internet. En prime, vous pouvez intégrer Xero à d’autres logiciels financiers.

Points forts

  • Les factures et les paiements sont automatiquement réalisés. Vous évitez ainsi les retards de paiement en améliorant la gestion du flux de trésorerie, ce qui constitue un aspect crucial pour la bonne santé financière de votre PME.
  • Il offre un accès en temps réel à toutes vos données financières grâce au cloud. Cette fonctionnalité vous assure une prise de décision rapide et informée, puisque vous avez toutes les informations nécessaires sous le nez. Ce point est particulièrement pertinent dans le cas d’un environnement commercial dynamique.
  • Xero s’intègre avec plus de 800 applications tierces, poussant la personnalisation du système comptable à son maximum. Grâce à ces intégrations, vous adaptez le système à vos besoins spécifiques, rendant la gestion financière plus fluide et moins sujette aux erreurs manuelles.
  • La plateforme facile la collaboration entre vos équipes en interne et les conseillers comptables. A fortiori, vous améliorez l’efficacité et la précision de la gestion comptable tout en permettant un niveau de supervision et de conseil professionnel plus élevé.

Inconvénient

Xero peut induire en erreur les débutants en comptabilité en raison de la difficulté à s'y habituer. Ce point est principalement dû à sa courbe d'apprentissage.

Prix

Xero offre une structure tarifaire adaptable avec différents niveaux de forfaits selon vos besoins.

Comment bien sélectionner votre logiciel de comptabilité pour votre PME : nos conseils

Malgré notre beau comparatif, vous ne parvenez pas à choisir votre logiciel ? Il est important de se pencher sur les éléments qui répondent aux principaux besoins des PME, et surtout à vos besoins à vous. Quel est votre budget ? Quelles sont vos connaissances en comptabilité ? Êtes-vous habitué à l’informatique ?

Si le doute persiste, voici quelques pistes :

  • la richesse fonctionnelle et la proposition de valeur ajoutée, il vaut mieux se pencher sur ces éléments essentiels à la comptabilité :
    • la création de devis et factures,
    • la connexion bancaire,
    • l’accès à l’expert-comptable,
    • l’export des écritures comptables,
    • le suivi de la trésorerie,
    • la gestion de la TVA, etc.,
  • l’ergonomie et de l’interface et la simplicité d’utilisation,
  • la structure de votre entreprise,
  • la sécurité de vos données,
  • vos connaissances en outils de comptabilité,
  • la notoriété du logiciel, son ancienneté sur le marché,
  • le rapport qualité/prix.

Pour plus de choix, n’hésitez pas à consulter notre article sur les meilleurs logiciels de comptabilité du marché. 💻

Ce qu’il faut retenir

La plupart des logiciels SaaS de comptabilité proposent des versions d’essai gratuites.

Essayez-les avant de faire votre choix final et sollicitez l’avis de votre entourage professionnel ainsi que de votre expert-comptable, si vous en avez un.

Vous pouvez aussi demander une démonstration, pour vous rassurer sur la facilité de prise en main et bénéficier d’un premier accompagnement, qui vous donnera aussi une bonne idée de la qualité du support client.

Autre conseil : choisissez une solution évolutive et modulable qui corresponde à vos besoins actuels, mais qui puisse aussi grandir avec vous.

Coralie Petit

Coralie Petit, Growth Editorial Manager

Après avoir décroché un master en traduction et communication, Coralie a plongé tête la première dans l'univers du SEO et de la rédaction web, séduite par la magie des mots et l'art de l'influence. Avec son expertise en réseaux sociaux, elle navigue dans la communication digitale comme un poisson dans l'eau. Parlant couramment l'anglais et le japonais, Coralie maîtrise les subtilités culturelles et linguistiques pour les appliquer au mieux dans la rédaction, captivant une large audience et un public tout aussi varié.

Fun fact : dans son temps libre, Coralie troque son clavier pour une manette et un tablier, passionnée par les jeux-vidéo et la food. Elle est même à la recherche du meilleur ramen de Paris. 🍜